CEAFOR, tiene la misión de contribuir al desarrollo de la investigación, transferencia de tecnología a través de la producción, asesoramiento especializado, oferta de plantas y semillas agroforestales de alta calidad genética, contribuyendo al proceso de enseñanza y aprendizaje de nuevos profesionales, bajo un liderazgo en el sector agroforestal.
Ser un centro de referencia en investigación, impulsor del desarrollo tecnológico y dinamizador de la transferencia de resultados al sector agroforestal, atreves de la producción, asesoramiento especializado, oferta de plantas y semillas agroforestales de alta calidad genética.
Propulsor de las plantaciones agroforestales en nuestro país.