La Universidad Autónoma Juan Misael Saracho, a través de la Secretaría de Educación Continúa en su misión de capacitar y lograr la excelencia académica de los profesionales, presenta la oferta académica de Posgrado para la gestión 2016 de los siguientes programas:
Maestría en Gestión Ambiental Maestría En “Dirección Y Administración De Empresas – MBA” Especialidad en Asesoría Corporativa Legal y Financiera 
Los programas se desarrollan en las sedes de posgrado en salud de la Universidad Autónoma Juan Misael Saracho en Tarija, Santa Cruz, Trinidad, La Paz, Oruro y Yacuiba.
Diplomado en Infectología Ambulatoria Especialidad en Investigación Clínico Epidemiológica Maestría en Enfermería en Terapia Intensiva con Escala Certificativa en Especialidad Maestría en Salud Pública con Mención en Gerencia y Economía de la Salud Epidemiología y Salud familiar y Comunitaria con Escala Certificativa en Especialidad Diplomado en Ecografía Básica Maestría en Gestión de la Calidad con Mención en Auditoria Médica y Auditoria en Salud con Escala Certificativa en Especialidad Maestría en Enfermería Médico Quirúrgica con Escala Certificativa en Especialidad Maestría en Enfermería Nefrológica y Urología con Escala Certificativa de Especialidad Mención en Diálisis y Hemodiálisis Diplomado en Emergencias y Urgencias Médicas Maestría en Bioquímica Clínica y Microbiología Maestría en Farmacología Clínica con Escala Certificativa de Diplomado en Bases Farmacológicas y Terapéuticas y Especialidad en Farmacología Terapéutica Maestría en Enfermería Neonatológica y Pediátrica con Escala Certificativa en Especialidad 
Diplomado en Juicios Orales Diplomado en Ordenamiento y Planificación Urbano Territorial Diplomado en Obras De Construcción Civil Diplomado Sistemas De Información Geográfica y Teledetección Maestría en Planificación, Evaluación y Gestión de Proyectos Diplomado en Herramientas Practicas Para Formulación, Evaluación y Gestión de Proyectos Maestría en Seguridad Informática 
Microsoft Excel Avanzado Liquidación de Beneficios Sociales y Elaboración de Planillas de Sueldos y Salarios Metodología de la Investigación Científica Simulador de Gestión Financiera para Emprendimientos Marketing en las Redes Sociales y Facebook Empresarial